پیادهسازی روش مدل مخفی مارکوف گسسته برای ساخت پروفایل
پنج سال پیش منتشر شده
تعداد بازدید: 482
کد پروژه: 142619
شرح پروژه
هدف از این تمرین پیادهسازی روش HMM برای ساخت پروفایل از روی یک همترازی چندگانه است. برای این منظور شما باید با استفاده از پایتون برای حل مسائل سه گانه HMM کدنویسی کنید. برنامه شما باید بتواند ابتدا از روی یک همترازی ساختار مدل را پیدا کند که در عمل پیدا کردن تعداد حالات M در Match State ها که در انتهای توضیح پروژه آمده است، خواهد بود. سپس با توجه به نمونه ها به صورت اتوماتیک تشخیص دهد که دنباله‌ها مربوط به DNA هستند و یا پروتئین (کاراکترها را بررسی و بر اساس آن تصمیم‌گیری کنید). پس از این پارامترهای مدل با استفاده از همترازی ورودی یادگرفته خواهند شد.
در مرحله ارزیابی دو دنباله جدید به شما داده خواهد شد. برای دنباله اول احتمال تولید آن با استفاده از مدل یادگرفته شده را باید بدست بیاورید (مسئله اول) و برای دنباله دوم باید محتملترین همترازی (دنباله حالات) را بدست بیاورید (مسئله دوم، ویتربی).
دقت شود که نباید به هیچ وجه از کدهای موجود در اینترنت استفاده شود و همچنین گزارش از کد به همراه کد ارسال شود.
این پروژه شامل 1 فایل مهم است، لطفا قبل از ارسال پیشنهاد حتما نسبت به بررسی این فایل اقدام فرمایید.
مهارت ها و تخصص های مورد نیاز
مهلت برای انجام
10روز
وضعیت مناقصه
بسته
درباره کارفرما
عضویت پنج سال پیش
