پروژه پایتون (9838)
پنج سال پیش منتشر شده
تعداد بازدید: 270
کد پروژه: 187894
شرح پروژه
سلام
اینجا دو دسته دیتا داریم دسته ی صفر و دسته ی یک که اول برای هر دسته دیتاهای تکراری باید توسط پایتون حذف بشن و بعد مراحل زیر برای هر دسته اجرا بشن
فایلی که به پیوست این ایمیل خدمت شما ارسال شده شامل پکیج iFeature برای محاسبه فیچرهاست.
برای استخراج فیچر ها لطفا به نکات زیر دقت فرمایید:
1- فایل های ورودی باید با فرمت fasta باشند، که بنده اسکریپت پایتونی به نام FastaFormatter.py برای این منظور آماده کردم و در همین پوشه قرار دارد.
نحوه اجرای اسکریپت به شکل زیر است:
python .\FastaFormatter.py "input_file_path.txt" "output_file_path.fasta"
فایل ورودی هم باید یک فایل text ساده باشد که در هر خط فقط شامل یک sequence است.
2- دو فایل به نام های Convert2Fasta.txt و CalcFeatures.txt که در اصل این ها batch file هایی هستند که بنده برای تسریع فرایند اجرای اسکریپت های مربوط به استخراج فیچرها و تبدیل فرمت فایل ها به fasta نوشتم و شما مطابق با نیاز خود باید کمی آنها را تغییر دهید.
لطفا اگر قبلا از پکیج iFeature استفاده نکرده اید، برای اینکه راحتتر چگونگی استفاده از را یاد بگیرید، پیشنهاد میکنم که فایل CalcFeatures.txt را مشاهده کنید. در هر خط از این فایل یک command جهت استخراج یک دسته feature نوشته شده (لطفا به آدرس فایل های ورودی و خروجی دقت کنید و متناسب با نیاز خود آنها را تغییر دهید).
شما میتوانید هر command را به صورت دستی تنظیم و اجرا کنید و یا اینکه فایل CalcFeatures.txt به CalcFeatures.bat تغییر نام داده و آن را اجرا کنید، که در این صورت همه command ها به صورت دسته ای و پشت سر هم اجرا میشوند.
* برای بالا بردن سرعت کار میتوانید همزمان چند ترمینال باز کنید و هر command را در ترمینال جداگانه ای اجرا کنید که کارها به صورت موازی و سریعتر انجام گیرد.
منظور ار فایل پیوست شده همون فایل فیچر هست که ارسال کردم
زمان زیادی ندارم نهایتا تا پنجشنبه
زیاد طول نمیکشه چون کدهاش هست فقط باید اجرا بشن
البته بهتره کسی انجام بده که علاوه بر پایتون یادگیری ماشین هم بلد باشه
این پروژه شامل 3 فایل مهم است، لطفا قبل از ارسال پیشنهاد حتما نسبت به بررسی این فایل اقدام فرمایید.
مهارت ها و تخصص های مورد نیاز
مهلت برای انجام
2روز
وضعیت مناقصه
بسته
درباره کارفرما
عضویت سیزده سال پیش
