نگارش مقاله در زمینه داکینگ مولکولی
شش ساعت پیش منتشر شده
تعداد بازدید: 43
کد پروژه: 622370
شرح پروژه
سلام
وقت بخیر
من قصد دارم پروژه داکینگ مولکولی (Molecular Docking) برای یک مقاله پژوهشی انجام دهم. می‌خواستم شرایط، هزینه، زمان تحویل و خروجی‌های کار شما را جویا شوم:
تعداد لیگاندها:۲ ترکیب طبیعی استخراج‌شده از گیاه (شامل Acacetin / 3-O-methylgalangin).
۲. تارگت
پروتئین مرتبط با سرطان پستان (مثلاً گیرنده استروژن آلفا ER\alpha با کد بلوری استاندارد یا دامنه اتصالی HSP90 به همراه داروی کنترل مثبت استاندارد).
نرم‌افزار اجرایپ ترجیحاً با AutoDock Vina یا ابزارهای استاندارد مشابه.
لطفاً بفرمایید آیا پکیج خروجی شما موارد زیر را شامل می‌شود؟
اعتبارسنجی اولیه (Re-docking لیگاند هم‌بلور و محاسبه مقدار RMSD)
جدول انرژی اتصال برای لیگاندها و داروی کنترل مثبت
تعیین دقیق اسیدهای آمینه درگیر، نوع برهم‌کنش‌ها (پیوند هیدروژنی، آبگریز و...) و طول پیوندها
تصاویر باکیفیت مناسب مقاله (شکل‌های ۲ بعدی از دیاگرام برهم‌کنش‌ها و شکل‌های ۳ بعدی قرارگیری در پاکت پروتئین)
> * ارائه فایل‌های ورودی و خروجی (شامل فایل‌های `.pdb` و `.pdbqt` و مختصات Grid Box جهت گزارش در بخش متدولوژی مقاله
هزینه انجام این آنالیز و مدت زمان تقریبی تحویل آن چقدر است؟
1.آیا فایل‌های خام (`pdbqt` و مختصات Grid Box) را تحویل می‌دهند؟
بسیار مهم است؛ چون داور مجله دقیقاً مرکز و ابعاد باکس (Center and Size of Grid Box) و فایل آماده‌شده را در بخش *Materials and Methods از ما می‌خواهد.
2.آیا Re-docking و محاسبه RMSD انجام می‌شود؟
3.آیا داروی کنترل مثبت (Control Drug) هم در کنار ترکیب شما داک می‌شود؟
مهارت ها و تخصص های مورد نیاز
بودجه
500,000 تومان تا 1,500,000 تومان
مهلت برای انجام
7روز
وضعیت مناقصه
باز (آماده دریافت پیشنهاد)
درباره کارفرما
عضویت سه سال پیش
